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柴益民1964年出生于浙江衢州,1987年从北京医科大学毕业,分配到上海第六人民医院骨科工作。1992年考入广州中山医科大学骨科,师从李佛保教授攻读硕士学位。1995年毕业后到海南省人民医院开云(中国),专门从事显微手外科工作。2005年又调回上海交通大学附属第六人民医院骨科,继续从事显微外科临床与教学工作。
另据“上海市第六人民医院”微信公号介绍,柴益民针对临床复杂组织缺损治疗困难,保肢率低的现状,建立了8个系列的修复重建关键技术体系,并提出保肢新策略。柴益民率领保肢团队累计诊治患者20000余例,将保肢率由先前的32.43%提高到64.43%,取得了巨大的社会效益。创立的保肢技术被2013年世界重建显微外科大会评为“近年世界重建新技术”之一。柴益民2016年入选上海领军人才培养计划,研究成果获得华夏医学科技一等奖,上海市科技进步一等奖等,并在国际、国内等多个有影响力的学术组织中任重要职务。
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